云南省农业科学院粮食作物研究所大豆课题宏转录组、WGS-GWAS、RNA-seq分析服务项目采购(2025.06）公开招标公告

公开招标公告

项目概况 云南省农业科学院粮食作物研究所大豆课题宏转录组、WGS-GWAS、RNA-seq分析服务项目采购(2025.06）招标项目的潜在投标人应在政采云平台（https://www.zcygov.cn）。获取招标文件，并于2025-07-07 09:30（北京时间）前递交投标文件。

一、项目基本情况

项目编号：YNZC2025-G3-03449-YNZG-0050

项目名称：云南省农业科学院粮食作物研究所大豆课题宏转录组、WGS-GWAS、RNA-seq分析服务项目采购(2025.06）

预算金额（万元）：12.852

最高限价（万元）：12.852

采购需求：1、WGS-GWAS，服务要求：实验：total DNA>1μg；释测序平台：illumina；测序策略：PE150；Q20≥90%；Q30≥85%；测序深度：5×以上；分析内容：测序数据质控（原始序列数据、测序数据统计、测序数据质量评估）；与参考基因组比对；SNP检测与注释；INDEL提取，群体分层分析（群体进化树分析、群体主成分分析）；连锁不平衡分析；全基因组关联分析（性状关联分析、目标性状相关区域基因功能注释）；构建单倍型图谱等。2、宏转录组，服务要求：使用Illumina NovaSeq X Plus仪器进行PE150双端测序，每个检测样本的数据量不低于6G clean data，Q30>90%；具有数据分析团队和服务器集群分析平台，提供专属高级宏转录组云分析流程，在线自主设置参数动态交互分析，绘图可直接下载。生物信息学分析：交互分析（不包括云工具）完成标准分析60+项：（1）数据预处理；（2）序列拼接组装：（3）基因预测：对拼接结果中的contigs进行ORF预测。（4）非冗余基因集构建（5）基因丰度统计（6）注释分析：使用DIAMOND将非冗余基因集与注释数据库进行比对（7）组成分析：基于物种丰度表和功能丰度表，进行物种与功能组成分析，提供Venn图、Bar图和Pie图、Heatmap图等。（8）比较分析：基于物种丰度表和功能丰度表，进行物种/功能比较分析，PCA分析、PCoA分析等。（9）差异分析：基于物种丰度表和功能丰度表，进行物种/功能差异分析（10）相关性分析（11）群落生物标志物筛选：随机森林，联合ROC分析，物种与功能贡献度分析、WGCNA分析等。3、RNA-seq，服务要求：使用IlluminaNovaSeqXPlus仪器进行PE150双端测序，每个检测样本的数据量不低于6Gcleandata，Q30>90%；具有数据分析团队和服务器集群分析平台，提供专属高级真核有参转录组云分析。;

合同履行期限：标段1:完成期限为接到送检样品之日起30日历天内完成。

本项目（否）接受联合体投标。

二、申请人的资格要求：

1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定；

2.落实政府采购政策需满足的资格要求：本项目专门面向中小微企业采购

3.本项目的特定资格要求：【包1】 3.1投标人应具有独立承担民事责任的能力，提供营业执照或事业单位法人证书等证明文件（原件扫描件加盖电子签章）。3.2投标人应具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度。投标人须提供财务状况报告或证明材料，内容可以为以下三者之一：(1)2025年1月1日前成立的投标人可提供以下①或②任意一种： ①提供2023年或2024年经第三方审计的财务报告及报表（报表至少应包括资产负债表、利润表（损益表）、现金流量表、所有者权益变动表及其附注），财务报告及报表须附可通过统一监管平台进行查验的验证二维码（扫描件加盖电子签章）；②提供自投标文件提交截止时间前三个月内基本开户银行出具的资信证明（原件扫描件加盖电子签章）。(2)2025年1月1日至今成立的投标人提供自成立至今的财务报表或提供具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度承诺书（或书面声明）（原件扫描件加盖电子签章）。(3)提供财政部门认可的政府采购专业担保机构出具的投标担保函（原件扫描件加盖电子签章）。3.3投标人应具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录，提供开标前1年期内任意3个月的依法缴纳税收和社会保障资金的证明材料（原件扫描件加盖电子签章），成立不足1年的投标人可提供自成立以来任意1个月的税收和社会保障资金缴纳凭证或相关情况说明（原件扫描件加盖电子签章）；投标人成立时间不足3个月的，提供情况说明即可（原件加盖电子签章）；依法免税或不需要缴纳社会保障资金的投标人，应提供相应文件（原件扫描件加盖电子签章）证明其依法免税或不需要缴纳社会保障资金。3.4投标人应具有履行合同所必需的设备和专业技术能力，提供承诺函或证明材料（扫描件加盖电子签章）。3.5投标人近三年内，在经营活动中没有重大违法记录（指投标人因违法经营受到刑事处罚或者责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款等行政处罚），提供承诺函（原件加盖电子签章）。3.6投标人未对本项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务，提供承诺函（原件加盖电子签章）。3.7投标人法定代表人或单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同投标人，不得同时参加本项目的投标，提供承诺函（原件加盖电子签章）。3.8符合法律、行政法规规定的其他条件，提供承诺函（原件加盖电子签章）。3.9因系统字数限制，本条内容详见其他补充事宜第1点。

三、获取招标文件

时间：2025-06-17 06:00至2025-06-24 23:59，每天上午06:00至12:00，下午12:00至23:59（北京时间，法定节假日除外）

地点：政采云平台（https://www.zcygov.cn）。

方式：（1）凡有意参加投标者，须在政采云平台办理数字证书（CA），CA申领链接：http://yzt.ynsmartcert.cn/cms/yztynzg12.html（客服热线：0871-67276028<紧急可拨19988166369>）或https://middle.zcygov.cn/ca/apply/edit?certType=32，并在政采云绑定数字证书（CA）后在网上获取采购文件及其它采购资料，数字证书（CA）详见其办理流程。注：云南本地供应商如之前已在云南CA在线数字证书办理网进行过注册并办理过企业数字证书（CA），直接绑定即可，无需重复办理（2022年1月1日前办理的云南CA需到云南CA办理处进行升级）。外省供应商在政采云平台办理的其他CA可直接使用，无需重复办理。（2）投标人登录政采云平台（https://www.zcygov.cn/）在线申请获取采购文件（进入“项目采购”应用，在“获取采购文件”菜单中选择本项目，申请获取采购文件）。（3）按上述要求获取文件的供应商视为合法获取了本项目采购文件，具备本项目的投标资格。

售价（元）：0

四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点

2025-07-07 09:30（北京时间）

地点：云南省昆明市盘龙区昆明市盘龙区北辰大道1号美立方商业广场B座16楼1601室开标室

五、公告期限

自本公告发布之日起5个工作日。

六、其他补充事宜

开标方式：网上开标

是否需要缴纳投标保证金：否

其他：1、申请人的资格要求：3.9根据《财政部关于在政府采购活动中查询及使用信用记录的通知》（财库[2016]125号）的要求，招标代理机构将通过“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）、“中国政府采购网”网站（www.ccgp.gov.cn）等渠道查询投标人的信用记录【查询时间为本公告发布之日起至提交投标文件截止之日止，查询结果以招标代理机构查询结果为准，并将查询记录和证据留存】，拒绝列入失信被执行人、重大税收违法失信主体、采购活动严重违法失信行为记录名单中的投标人参加本项目的投标活动（此部分由代理机构查询即可，投标人无需提供）。2.本次招标落实扶持福利企业、支持中小微企业、支持监狱和戒毒企业、支持残疾人福利性单位政策等相关政策。3.本项目招标公告发布媒介为“云南省政府采购网”（www.yngp.com）和“政采云平台”（https://www.zcygov.cn/），我公司对其他网站转载的公告信息不承担任何责任。4.本项目实行网上投标，采用电子投标文件，开标方式为线上不见面开标，投标人无需派人到招标代理公司。5.各投标人应在开标前应确保成为政采云平台供应商，并完成CA数字证书申领。因未注册入库、未办理CA数字证书等原因造成无法投标或投标失败等后果由投标人自行承担。6.凡有意参加投标的投标人，须在云南省数字证书认证中心https://cap.yunnanca.net/login办理数字证书（CA），并通过政采云绑定数字证书（CA）后在网上获取招标文件及其它招标资料，数字证书（CA）详见其办理流程。注：投标人如之前已在云南CA在线数字证书办理网进行过注册并办理过企业数字证书（CA）的，直接绑定即可，无需重复办理（2022年1月1日前在云南省公共资源交易平台办理过云南CA证书的需到原办理点进行升级后方可使用）。外省投标人在政采云平台办理的其他CA可直接使用，无需重复办理。投标人通过CA证书获取招标文件的视为合法获取了项目招标文件，具备本项目的投标资格。7.投标人将政采云电子交易客户端下载、安装完成后，可通过账号密码或CA登录客户端进行投标文件的制作。在使用政采云投标客户端时，建议使用WIN7（64位）及以上操作系统。客户端请至政采云公司网站（https://edu.zcygov.cn/luban/yunnan-dzjy-gys）进行查看下载，如有问题可拨打政采云客户服务热线400-881-7190进行咨询。如因投标人自身原因导致在规定时间内无法正常解密的（如：浏览器故障、未安装相关驱动、网络故障、加密CA与解密CA不一致等），代理机构不予异常处理，视为投标人自动放弃投标。

七、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。

1.采购人信息

名 称：云南省农业科学院粮食作物研究所

地址：云南省昆明市盘龙区北京路2238号

联系方式：0871-65894983

2.采购代理机构信息

名 称：云南众高工程咨询有限公司

地址：云南省昆明市盘龙区北辰大道1号美立方商业广场B座16楼

联系方式：0871-67357686

3.项目联系方式

项目联系人：王蒙、可兆伟、陈主娥、卯明艳、杨光菲

电　话：0871-67357686